Flere studier peger på, at kaffe indeholder antioxidanter, som kan hæmme væksten af kræftceller, og at et moderat kaffeforbrug kan være forbundet med en lavere risiko for visse kræftformer, især lever- og tarmkræft. Samtidig har nogle studier peget på, at et meget højt og langvarigt forbrug muligvis kan hænge sammen med forstadier til mavekræft.
Resultaterne varierer dog mellem studier, blandt andet på grund af forskelle i studiedesign, kaffetype, tilberedning og individuel koffeintolerance. Samlet set tyder forskningen på en overordnet sammenhæng mellem kaffeforbrug og lavere risiko for flere kræftformer i fordøjelsessystemet, men der er behov for mere forskning for at forstå de præcise mekanismer
